三菱系列plc程序流程操控运用指令共有十条，指令编号为FNC00～FNC09。它们在程序中的条件施行与优先处理，与顺控程序的操控流程有关。

一、条件跳转指令

条件跳转指令CJ（Conditional Jump，FNC00）用于越过次第程序中的某一有些，以操控程序的流程。指针P（Point）用于指示分支和跳步程序，在梯形图中，指针放在左面母线的左面。

二、子程序调用与回来指令

子程序是为一些特定的操控意图编制的相对独立的程序。子程序调用指令CALL（Sub- Routine Call，FNC01）用于子程序的调用，各子程序用指针P0～P62及P64～P127标明。

三、接连指令

接连是核算机所特有的一种作业办法，指主程序的施跋涉程中，接连主程序的施行去施行接连子程序。系列PLC的接连作业包含输入接连、守时接连和高速计数器接连。

四、主程序完毕指令

主程序完毕指令FEND（First End，FNC06）标明主程序的完毕和子程序的开端。

五、监控守时器指令

监控守时器又称看门狗，在施行FEND和END指令时，监控守时器被改写（复位），PLC正常作业时扫描周期小于它的守不时刻。

六、程序循环指令

程序循环指令由FOR 及NEXT两条指令构成。

FOR 指令用来标明循环区的起点，NEXT标明循环区完毕，FOR与NEXT之间的程序被重复施行，施行完后，施行NEXT后边的指令。